ภาษาของ DNA เป็นความอุดมสมบูรณ์อย่างแท้จริง
ของคำอุปมาและความคิดโบราณ666slotclub เนื่องจาก James Watson และ Francis Crick แก้ปัญหาเกลียวคู่ นักชีววิทยาได้จินตนาการว่า DNA เป็นอุปกรณ์จัดเก็บข้อมูล: เทปแม่เหล็ก โปรแกรมคอมพิวเตอร์ หรือหนังสือที่มีคำแนะนำในการสร้างโปรตีนของเซลล์ ในสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์ หนังสืออันล้ำค่านี้ถูกเก็บรักษาไว้ในห้องนิรภัยของนิวเคลียส ซึ่งเมมเบรนจะแยกและปกป้องธรรมชาติจากการหล่อเลี้ยง
แต่ถ้าจีโนมเป็นข้อความ แสดงว่ามีการแก้ไขที่ไม่ดี DNA ส่วนใหญ่นั้นพูดพล่อยๆ เต็มไปด้วยการพูดติดอ่าง เกร็ดเล็กเกร็ดน้อยของ doggerel จากสายพันธุ์อื่น และเสียงสะท้อนของไวรัสที่สงบนิ่ง ในมนุษย์ มีเพียง 2% ของจีโนมเท่านั้นที่เข้ารหัสโปรตีน ส่วนใหญ่—แต่ไม่ทั้งหมด—จาก 98% ที่เหลือเป็นเศษซากจากการวิวัฒนาการ ในปี 1960 นักวิจัยได้เรียนรู้ว่า DNA ที่ไม่ได้เข้ารหัสสามารถทำหน้าที่สำคัญ เช่น ควบคุมการทำงานของยีนและการสร้างไรโบโซม ส่วนที่เหลือพวกเขาเริ่มเรียกว่าขยะ
วันนี้ DNA ขยะเป็นหัวใจของการเปลี่ยนแปลงที่รุนแรงที่สุดของการทำความเข้าใจจีโนมตั้งแต่การอุปมาข้อมูล หนังสือสามเล่ม — The Deeper Genome โดย John Parrington, DNA ขยะ โดย Nessa Carey และ Biocode โดย Dawn Field และ Neil Davies — นำเสนอวิสัยทัศน์ของจีโนมในศตวรรษที่ 21 ความสำเร็จของพวกเขาขึ้นอยู่กับอุปมาและจินตภาพ ทั้งในแง่ของการสร้างจีโนมและในการเขียน
ในเดือนกันยายน 2555 สมาคม ENCODE (สารานุกรมขององค์ประกอบดีเอ็นเอ) ประกาศว่าความพยายามระหว่างประเทศหลายปีในการจัดทำรายการลำดับดีเอ็นเอประเภทต่างๆ ได้กำหนด “หน้าที่ทางชีวเคมี” ให้กับ 80% ของจีโนมมนุษย์ นักข่าวที่ไม่ระมัดระวังเริ่มตะโกนว่าขยะมีสองชั้น แม้ว่าฉันทามติทางวิทยาศาสตร์จะยืนยันว่าจีโนมส่วนใหญ่มีจำนวนมาก การอภิปรายต่อมาได้ควบคุมความสนใจของสาธารณชนใน DNA ที่ไม่เข้ารหัส — แต่เราจะพูดถึง DNA ได้อย่างไรในตอนนี้
ชื่อเรื่อง Biocode ช่วยป้องกันข้อสงสัยใด ๆ ที่ผู้เขียนใช้คำอุปมาของข้อมูล Field และ Davies สำรวจความคิดเห็นและคำมั่นสัญญาเกี่ยวกับจีโนมิกส์อย่างไม่หยุดยั้ง รวมถึงการฟื้นคืนชีพของสปีชีส์ที่สูญพันธุ์ในสไตล์จูราสสิค พาร์ค ไมโครไบโอม และวิศวกรรมสิ่งแวดล้อม เนื้อหาบางตอนได้กล่าวถึงข้อค้นพบล่าสุด โดยแต่ละตอนมีการคาดเดาที่น่าตื่นตาซึ่งส่วนใหญ่เป็นการฝึกฝนคำถามด้านจริยธรรมที่คุ้นเคย ระยะห่างที่สำคัญเกิดขึ้นได้ด้วยค่าลบสองเท่าที่ให้เกียรติเวลา: “วันหนึ่งทนายความอาจโต้แย้งว่าจงใจไม่ให้ [ลูกหลานของเรา] ยีนที่ดีที่สุดที่มีอยู่เป็นรูปแบบหนึ่งของการละเมิด? เป็นไปไม่ได้เลยที่จะจินตนาการถึงโลกที่การสืบพันธุ์ตามธรรมชาติจะดูเหมือนดั้งเดิมและป่าเถื่อน” สรุปโดยแนะนำให้เราตั้งเป้าหมายในโครงการจีโนมระดับโลกเพื่อทำความเข้าใจ “ซอฟต์แวร์ที่หล่อหลอมโลกของเรา” รหัสชีวภาพคือ Gaia บวก DNA แต่ความคิดโบราณสองคำไม่สมเหตุสมผล Biocode เพียงขยายคำอุปมาข้อความไปยังมหภาค
อุปมาแบบเก่าไม่ผิด มันไม่สมบูรณ์ ในจีโนมใหม่
บรรทัดของรหัสคงที่ได้กลายเป็นสายอักขระที่สำคัญสามมิติที่พันกัน ซึ่งพับและจัดเรียงใหม่อย่างต่อเนื่อง ซึ่งตอบสนองต่ออินพุตภายนอก รากเหง้าของความคิดนี้ลึกล้ำ ในการบรรยายโนเบลปี 1983 ของเธอ นักพันธุศาสตร์ Barbara McClintock เรียกจีโนมว่าเป็น “อวัยวะที่ละเอียดอ่อนของเซลล์” McClintock ผู้ค้นพบองค์ประกอบทางพันธุกรรมเคลื่อนที่ในช่วงทศวรรษที่ 1940 ได้ตั้งชื่อองค์ประกอบเหล่านี้ว่าควบคุมเพราะเธอคิดว่าองค์ประกอบเหล่านี้ประกอบด้วยระบบการกำกับดูแลที่ควบคุมการทำงานของยีน ในปี 1980 Ford Doolittle และ Carmen Sapienza เสนอว่า transposons เป็นปรสิตระดับโมเลกุล โดยกระโดดเข้าไปในจีโนมเพื่อขยายพันธุ์ตัวเอง Parasitic transposons ตอนนี้เป็นความรู้ในตำรา แต่ประเด็นที่ใหญ่กว่าของ McClintock ถือเป็น: จีโนมเป็นแบบไดนามิกซึ่งเต็มไปด้วยองค์ประกอบด้านกฎระเบียบที่ตอบสนองต่อตัวชี้นำด้านสิ่งแวดล้อม
Deeper Genome เป็นหนังสือเล่มเดียวในสามเล่มที่ให้เครดิต McClintock ว่าเป็นบรรพบุรุษของจีโนมสามมิติ นักวิทยาศาสตร์และนักข่าว Parrington กล่าวถึงเรื่องราว ENCODE สำหรับ The Times ในปี 2012; หนังสือของเขาทำให้เรื่องราวเหล่านั้นสมบูรณ์ขึ้นด้วยบริบททางประวัติศาสตร์และวิทยาศาสตร์ วิทยาศาสตร์ดีกว่าประวัติศาสตร์ เขาได้อภิปรายอย่างละเอียดเกี่ยวกับการสนับสนุนล่าสุดสำหรับการทำงานช่วงสายของ McClintock ที่มักถูกมองข้ามว่าความเครียดสามารถกระตุ้นการขนย้ายได้อย่างไร แต่เขาได้สานต่อตำนานที่ว่าในตอนแรกไม่มีใครคิดว่าการขนย้ายมีจริง ประเด็นที่โต้แย้งกันคือการตีความองค์ประกอบมือถือของ McClintock ในฐานะผู้ควบคุมการทำงานของยีน บทที่แข็งแกร่งที่สุดของ Parrington สำรวจมุมมองที่เกิดขึ้นใหม่เกี่ยวกับการควบคุมยีน รวมถึงการพับของ DNA, epigenetics และ RNA ตามกฎข้อบังคับ โดยรวมแล้ว นี่เป็นภาพที่ซื่อสัตย์และน่าสนใจของจีโนมในศตวรรษที่ 21
ในที่สุด DNA ขยะก็เหมือนกับจีโนมที่อัดแน่นไปด้วยองค์ประกอบที่ซ้ำซากจำเจและข้อความที่ไม่จำเป็น ขบวนพาเหรดบทขนาดกัด gee-whizz ของจีโนม The Epigenetics Revolution ของ Carey (สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยโคลัมเบีย, 2012) นำเสนอการเขียนทางวิทยาศาสตร์ที่ชัดเจนและภาพที่สดใส อุปมาอุปมัยได้ถูกละระเบียบออกไปแล้ว: พวกมันแพร่กระจายผ่านการสำรวจ DNA ที่ไม่เข้ารหัสซึ่งมีความรู้ ถึงจุดหนึ่งผู้อ่านต้องฝ่าฟัน o 666slotclub
