แม้แต่ยีนที่ขาดหายไปสองสามตัวในจีโนมที่สร้างขึ้นใหม่ของสัตว์ก็อาจเป็นปัญหาได้
ก่อนต้นทศวรรษ 1900 ถ้ามันเดินเหมือนหนูเกาะคริสต์มาสสล็อตแตกง่ายและพูดเหมือนหนูเกาะคริสต์มาส ก็น่าจะเป็นหนูเกาะคริสต์มาส แต่ถ้าหนูตัวใดตัวหนึ่งที่สูญพันธุ์ไปแล้วเหล่านี้ได้กลับมาเดินบนโลกอีกครั้ง ก็น่าจะเป็นหนูสีน้ำตาลนอร์เวย์ดัดแปลงพันธุกรรม การศึกษาใหม่พบว่าหนูจะไม่เหมือนกับหนูเกาะคริสต์มาสอย่างที่บางคนหวัง
ด้วยการกำเนิดของเทคโนโลยีการแก้ไขยีนเช่น CRISPRนักวิทยาศาสตร์ได้เปลี่ยนจากการโคลนนิ่งเป็นพันธุวิศวกรรมเป็นวิธีที่มีแนวโน้มมากที่สุดสำหรับ “การสูญพันธุ์” หรือการฟื้นคืนชีพของสายพันธุ์ที่ตายไปแล้ว ( SN: 10/7/20 ) . แต่แตกต่างจากการโคลนนิ่ง พันธุวิศวกรรมจะไม่สร้างแบบจำลองที่แน่นอนของสายพันธุ์ที่สูญพันธุ์ เทคนิคนี้จะแก้ไขจีโนมของสัตว์ที่มีอยู่เพื่อให้คล้ายกับของสัตว์ที่สูญพันธุ์ที่ต้องการ ความท้าทายคือการทำให้พร็อกซีนั้นคล้ายกับสายพันธุ์ที่สูญพันธุ์มากที่สุด
เพื่อสำรวจขีดจำกัดของวิธีนี้ นักวิจัยพยายามกู้คืนจีโนมของหนูเกาะคริสต์มาส โดยการเปรียบเทียบชิ้นส่วนของหนังสือคำแนะนำทางพันธุกรรมของหนูที่สูญพันธุ์กับจีโนมของญาติที่มีชีวิต หนูสีน้ำตาลของนอร์เวย์ ทีมงานสามารถกู้คืนจีโนมที่สูญพันธุ์ไปแล้วได้ประมาณ 95 เปอร์เซ็นต์ ฟังดูเหมือนเยอะ แต่หมายความว่า5 เปอร์เซ็นต์ของจีโนมยังคงหายไปรวมถึงบางภูมิภาคที่มีความสำคัญต่อการดมกลิ่นและระบบภูมิคุ้มกัน นักวิทยาศาสตร์รายงานในCurrent Biology เมื่อวัน ที่ 11 เมษายน
“คุณสามารถนำสิ่งที่พบกลับมาได้เท่านั้น และประเด็นของเราคือเราไม่สามารถค้นหาทุกสิ่งได้” Tom Gilbert นักชีววิทยาด้านวิวัฒนาการจากมหาวิทยาลัยโคเปนเฮเกนกล่าว
เพื่อให้ได้จีโนมของหนูที่สูญพันธุ์ กิลเบิร์ตและเพื่อนร่วมงานของเขาได้นำ DNA โบราณจากตัวอย่างผิวหนังสองชิ้นของหนูเกาะคริสต์มาสที่เก็บรักษาไว้ DNA โบราณที่สกัดจากตัวอย่างที่ตายตั้งแต่สองสามทศวรรษจนถึงหลายพันปีก่อนนั้นยังห่างไกลจากความสมบูรณ์แบบ ( SN: 5/19/08 ) กิลเบิร์ตอธิบายจีโนมของสัตว์ที่สูญพันธุ์ไปแล้วว่าเป็นหนังสือที่ถูกฉีกเป็นชิ้นเล็กชิ้นน้อย วิธีหนึ่งในการสร้างหนังสือที่หั่นเป็นชิ้นใหม่คือการสแกนเศษชิ้นส่วนและเปรียบเทียบกับข้อมูลอ้างอิง
ด้วยสำเนาที่ครบถ้วนของหนังสือต้นฉบับ ใครบางคนสามารถสร้างหนังสือขึ้นมาใหม่ในทางทฤษฎีได้อย่างสมบูรณ์แบบ เมื่อระบุจีโนมอ้างอิง นักวิจัยมองหาสปีชีส์ที่แยกตัวออกจากวิวัฒนาการจากสปีชีส์ที่สูญพันธุ์ไปเมื่อเร็วๆ นี้ กล่าวคือ หนังสือที่คล้ายกันมาก จีโนมจะเข้าคู่กันอย่างใกล้ชิด แต่ไม่สมบูรณ์
ด้วยเหตุนี้ หนูเกาะคริสต์มาส ( Rattus macleari )
จึงเป็นตัวเลือกที่ชัดเจนสำหรับการวิเคราะห์สำหรับนักวิทยาศาสตร์ มันแยกตัวจากญาติสนิท คือ หนูสีน้ำตาลนอร์เวย์ ( Rattus norvegicus ) เมื่อประมาณ 2.6 ล้านปีก่อนเท่านั้น
ทีมงานพบว่าจีโนมหนูเกาะคริสต์มาสจับคู่กับจีโนมหนูสีน้ำตาลของนอร์เวย์ประมาณ 95 เปอร์เซ็นต์ การวิเคราะห์เพิ่มเติมพบว่าประมาณ 5 เปอร์เซ็นต์ที่หายไปไม่สามารถอธิบายได้ด้วยข้อบกพร่องในเทคนิคหรือจีโนมอ้างอิงที่ไม่เพียงพอ แต่เนื่องจากความแตกต่างทางวิวัฒนาการระหว่างสองสปีชีส์ ข้อมูลทางพันธุกรรมส่วนใหญ่จึงสูญหายไป
ยิ่งไปกว่านั้น ข้อมูลที่หายไปนั้นไม่ได้เกิดขึ้นโดยบังเอิญ ยีนที่หายไปบางส่วนหรือทั้งหมดมีแนวโน้มที่จะตกอยู่ในสองส่วนหลักที่ควบคุมการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันของหนูและการรับกลิ่น ดังนั้น ถ้าจีโนมของหนูสีน้ำตาลนอร์เวย์ได้รับการแก้ไขให้คล้ายกับหนูเกาะคริสต์มาส สัตว์เลื้อยคลานตัวใหม่จะมีกลิ่นที่แตกต่างจากต้นแบบของมัน สิ่งนี้อาจขัดขวางโอกาสรอดของหนูเกาะคริสต์มาสพร็อกซี่ หากมันถูกปล่อยสู่ถิ่นที่อยู่เดิม
กิลเบิร์ตไม่คิดว่าจะมีใครพยายามกำจัดหนูให้สูญพันธุ์ แต่เขาบอกว่าสิ่งที่ทีมได้แสดงให้เห็นสามารถพิสูจน์ได้ว่ามีประโยชน์สำหรับคนที่ทำงานในโครงการที่มีความทะเยอทะยานมากขึ้น เช่น การนำแมมมอธขนสัตว์กลับคืนมา ยกตัวอย่างเช่น ความแตกต่างระหว่างหนูสีน้ำตาลนอร์เวย์กับหนูเกาะคริสต์มาสที่สูญพันธุ์ไปแล้วนั้น คล้ายกับความแตกต่างระหว่างช้างเอเชียกับแมมมอธขน
กิลเบิร์ตกล่าวว่า “โดยการวิเคราะห์ประเภทนี้ ซึ่งไม่ยากที่จะทำ อย่างน้อยที่สุดคุณสามารถคิดได้ว่าคุณจะได้อะไร อะไรที่คุณจะไม่ได้ และคุณสามารถใช้สิ่งนั้นเพื่อตัดสินใจว่าควรทำอย่างไร” กิลเบิร์ตกล่าว
เบ็น โนวัค นักวิทยาศาสตร์ชั้นนำของ Revive & Restore องค์กรไม่แสวงหาผลกำไรที่ใช้พันธุวิศวกรรมสำหรับโครงการอนุรักษ์กล่าวว่าแม้จะมีอุปสรรค แต่การใช้เทคโนโลยีเพื่อนำสิ่งมีชีวิตกลับคืนมาก็ยังคุ้มค่าที่จะทำ เขาวางแผนที่จะใช้การวิเคราะห์ของกิลเบิร์ตและเพื่อนร่วมงานกับงานของเขาเกี่ยวกับนกพิราบโดยสารซึ่งสูญพันธุ์ไปในปี 2457 มีวิธีแก้ไขที่เป็นไปได้สำหรับวิธีการรวบรวมข้อมูลบางส่วนที่หายไป เขากล่าว แต่ข้อเท็จจริงที่ว่าข้อมูลบางส่วนมักจะเป็นเสมอ สิ่งที่ขาดหายไปนั้นเป็นข้อจำกัดที่นักวิทยาศาสตร์การสูญพันธุ์ได้บรรลุข้อตกลงแล้ว
“ปัญหาการประกอบอ้างอิงจะเป็นอุปสรรคต่อการสูญพันธุ์เสมอ” โนวัคกล่าว “ใครก็ตามที่ไล่ตามการสูญพันธุ์ต้องจัดการกับความจริงที่ว่าเราต้องการเข้าใกล้ให้มากที่สุดเท่าที่จะทำได้เพื่อทำสิ่งที่หลอกหลอนสิ่งแวดล้อม”สล็อตแตกง่าย
